Sebagai warisan sejarah, Benteng Tolukko terus diupayakan untuk dilestarikan agar generasi mendatang dapat memahami serta menghargai jejak kolonialisme yang pernah ada. Benteng ini menjadi pengingat akan perjalanan panjang kerajaan rempah yang pernah ada di Ternate, serta betapa pentingnya pulau ini dalam peta sejarah perdagangan internasional.
Dari benteng ini, kita dapat memperoleh pelajaran berharga mengenai dampak kolonialisme yang tidak hanya mengubah tatanan politik tetapi juga meresap dalam kehidupan sosial dan budaya masyarakat setempat. Sejarah rempah-rempah dan Benteng Tolukko mengajarkan kita tentang dinamika kekuasaan dan bagaimana sebuah tempat dapat menjadi saksi bisu perjalanan panjang sejarah manusia. Ternate dengan segala keunikannya, terus menjadi bagian penting dalam catatan sejarah rempah yang mengubah dunia.