Pada dini hari dan pagi hari Kamis, 13 September 2025, wilayah Gunung Kidul, Yogyakarta, diguncang oleh dua kejadian gempa bumi tektonik yang cukup signifikan. Berdasarkan informasi dari Badan Meteorologi Klimatologi dan Geofisika (BMKG), gempa pertama terjadi pada pukul 01.16 WIB dengan kekuatan magnitudo 3.5, diikuti oleh gempa susulan yang terjadi pukul 06.48 WIB dengan magnitudo yang lebih kuat, yakni 3.6. Kedua gempa ini berada di lokasi yang sama, yaitu di laut Samudera Hindia, dan merupakan bagian dari aktivitas seismik yang sering terjadi di wilayah tersebut.
Pusat gempa pertama terletak pada koordinat 9.40 derajat Lintang Selatan dan 110.37 derajat Bujur Timur. Jaraknya sekitar 158 kilometer arah Barat Daya dari Gunung Kidul, dan kedalaman gempa tersebut mencapai 10 kilometer. Tren aktivitas gempa ini mencerminkan sifat geologis daerah Yogyakarta yang terletak di zona subduksi antara lempeng Eurasia dan lempeng Indo-Australia.