Sementara itu, panaskan minyak goreng di dalam panci. Tumis bumbu yang sudah dihaluskan hingga harum. Pastikan Anda memasak bumbu dengan api sedang agar tidak gosong. Setelah bumbu tercium aromanya yang sedap, masukkan batang serai, daun jeruk, dan daun salam. Aduk rata dan biarkan bumbu semakin meresap.
Setelah itu, masukkan ikan patin ke dalam panci dan aduk perlahan agar bumbu dapat melapisi ikan secara merata. Tuangkan air sebanyak 1 liter ke dalam panci, kemudian tambahkan larutan asam jawa, garam, dan gula secukupnya. Aduk kembali dan biarkan mendidih.
Setelah air mendidih, kecilkan api dan biarkan ikan patin dimasak secara perlahan agar bumbu meresap dengan baik ke dalam daging ikan. Proses memasak ini biasanya memakan waktu sekitar 20-30 menit. Pastikan ikan patin dimasak sampai matang dan dagingnya mudah terpisah dari tulang.
Selama proses memasak, Anda dapat mencicipi kuahnya dan menyesuaikan rasa asam, manis, dan asin sesuai dengan selera Anda. Pindang patin biasanya memiliki rasa yang sedikit asam dan pedas, sehingga rasanya bisa disetel dengan menambah atau mengurangi jumlah asam jawa dan cabai.