Reaksi masyarakat terhadap tragedi ini beragam. Umat Islam yang dulunya terpecah mulai menyatu untuk memperjuangkan hak-hak mereka. Tragedi Tanjung Priok menjadi titik tolak bagi beberapa organisasi Islam untuk berbicara lebih keras mengenai kebebasan beragama dan hak asasi manusia. Meski banyak yang terpaksa bersembunyi dan menjalani hidup dalam ketakutan, namun semangat perjuangan mereka tetap menyala.
Berdirinya komunitas-komunitas baru, seminar-seminar keagamaan, serta gerakan sosial untuk mendukung hak-hak sipil semakin tumbuh subur di kalangan umat Islam. Meskipun ancaman terus membayangi, darah yang telah tertumpah di Tanjung Priok takkan pernah sia-sia. Doa dan harapan mereka akan sebuah perubahan yang lebih baik untuk generasi mendatang terus bergema di setiap sudut negeri.
