Tidak hanya pengalihan, Transjakarta juga melakukan perpendekan beberapa rute. Misalnya, Koridor 7 yang biasanya melayani rute Kampung Melayu–Kampung Rambutan, kini hanya melayani perjalanan Kampung Rambutan–BNN. Perubahan juga terjadi pada Koridor 14 yang biasanya melayani rute Jakarta International Stadium (JIS)–Senen, kini dipangkas menjadi JIS–Tanah Tinggi sejak pukul 05.00 WIB. Hal ini dilakukan untuk menyesuaikan akses jalan yang masih dapat dilalui dengan aman oleh armada bus.
Layanan angkutan integrasi Transjakarta juga tidak luput dari penyesuaian. Rute 6H Senen–Lebak Bulus dialihkan melalui Jalan Budi Utomo mulai pukul 05.00 WIB. Hal yang sama diberlakukan pada rute 1R Terminal Blok M–Tanah Abang, serta rute 2P Senen–Transhub Dukuh Atas, yang juga dialihkan melalui Jalan Budi Utomo. Selain itu, rute 5N Kampung Melayu–Ragunan dipangkas menjadi Ragunan–kolong Flyover Kampung Melayu–Ragunan. Adapun rute 5B Bidara Cina–Stasiun Tebet untuk sementara dihentikan operasinya. Sementara rute 2H Rusun Jatirawasari–Senen kini hanya beroperasi hingga BS Honda Letjen Suprapto.
Perubahan pun berlaku pada layanan mikrotrans. Jalur JAK02 Duren Sawit–Kampung Melayu untuk sementara berhenti beroperasi. JAK10B yang biasanya melayani rute Stasiun Gondangdia–Cikini via Kramat dialihkan melalui Jalan Prajurit KKO Kwitang arah Senen. Sedangkan JAK17 rute Pulogadung–Terminal Senen dialihkan melalui Jalan Kramat Raya.
