Pendekatan naratif yang diambil dalam film "Kiblat" juga menjadi faktor kontroversial. Alur cerita yang digambarkan dalam film ini tidak mengikuti pola konvensional yang biasa ditemui pada film-film mainstream. Perubahan-perubahan naratif yang dihadirkan dalam film ini membuat beberapa penonton merasa kebingungan atau terganggu, sementara yang lain menganggapnya sebagai pencerahan artistik.
Tidak hanya itu, tema-tema yang diangkat dalam film "Kiblat" seringkali menyinggung nilai-nilai konservatif di masyarakat. Film ini membahas isu-isu keagamaan, gender, dan politik dengan sudut pandang yang dianggap kontroversial oleh sebagian pihak. Terlepas dari tujuan mendidik atau menggugah kesadaran, pilihan tema yang diangkat dalam film ini kadang menjadi pemicu kontroversi di kalangan pemirsa.
