Perlindungan juga menjadi salah satu peran penting terumbu karang dalam memberikan habitat bagi berbagai spesies laut. Terumbu karang menyediakan perlindungan bagi hewan-hewan laut dari gelombang dan arus laut yang kuat, serta dari predator-predator laut. Banyak ikan karang menggunakan rongga-rongga terumbu karang sebagai tempat berlindung. Terumbu karang juga menjadi tempat bertelur bagi beberapa spesies ikan, menyediakan ruang yang aman bagi larva-larva ikan untuk tumbuh dan berkembang.
Terumbu karang juga menawarkan keanekaragaman hayati yang sangat besar. Diperkirakan terdapat jutaan spesies hewan dan tumbuhan yang hidup di sekitar terumbu karang, menjadikannya salah satu ekosistem paling beraneka ragam di dunia. Dengan keanekaragaman hayati yang tinggi, terumbu karang memberikan peluang hidup yang besar bagi berbagai spesies laut, mulai dari hewan-hewan yang paling kecil hingga yang paling besar.
Namun, terumbu karang saat ini menghadapi berbagai ancaman, seperti perubahan iklim, polusi, dan aktivitas manusia yang merusak. Perubahan suhu laut yang ekstrim, pencemaran laut, dan pengambilan sumber daya alam di sekitar terumbu karang dapat merusak ekosistem ini dan mengancam keberlangsungan hidup berbagai spesies laut yang bergantung padanya.