Di MotoGP 2018, Morbidelli akan membela tim Marc VDS Honda bersama Thomas Luthi menggantikan Jack Miller dan Tito Rabat yang pindah ke tim lain.
Morbidelli merupakan salah satu jebolan VR46 Academy yang merupakan akademi balap milik Valentino Rossi. Tapi di MotoGP 2018 kedua pembalap tersebut akan bersaing untuk menjadi yang terbaik. Persaingan sepertinya akan berlangsung sangat ketat karena Rossi membela tim Yamaha dan Morbidelli membela tim Honda.
Rossi pun percaya anak didiknya akan mampu bersaing dengan dirinya maupun para pembalap lainnya."Saya pikir ia juga bisa menjadi kompetitif di kelas MotoGP. Memang benar bahwa kami akan menjadi pesaing dan kurang banyak membicarakan masalah teknis. Tapi, menurut saya hubungan kami tak akan berubah," kata Rossi, dilansir Speedweek.