Akselerasi motor elektrik seperti Ninja E-1 dipengaruhi oleh Riding Mode yang digunakan, yakni Eco dan Road dengan tambahan fitur e-boost. Mode Eco menawarkan tarikan yang cukup pelan, sesuai dengan tujuannya untuk menghemat daya listrik baterai. Namun, jarak tempuh menggunakan Riding Mode Eco bisa mencapai 72 km, sangat menguntungkan untuk penggunaan urban yang cukup padat.
Di sisi lain, Riding Mode Road menampilkan respon yang lebih responsif, terutama saat motor melaju di atas kecepatan 50 km/jam. Kemudian, ditambah dengan fitur e-boost, Ninja E-1 mampu memberikan dorongan torsi awal yang mengesankan, memungkinkan roda belakang untuk spin dengan mudah.
Namun, fitur e-boost ini juga memiliki keterbatasan. Setelah diaktifkan, e-boost memerlukan jeda waktu sekitar 30 detik hingga 1 menit sebelum dapat digunakan kembali. Meskipun begitu, fitur ini memungkinkan motor untuk memberikan dorongan tenaga tambahan hingga 15 detik, sebuah fitur yang luar biasa untuk motor listrik.
Dari sisi performa, jika dibandingkan dengan motor sport 150 cc, meskipun Ninja E-1 unggul dalam hal teknologi dan keberlanjutan lingkungan, namun masih kalah dalam hal akselerasi dan kecepatan maksimal. Hal ini dapat menjadi pertimbangan bagi calon pembeli yang sering menggunakan motor untuk perjalanan jarak jauh atau memerlukan akselerasi yang cepat dalam kondisi tertentu.