Setelah kepemimpinan Faisal Basri berakhir, Sri Mulyani Indrawati kemudian mengambil alih posisi tersebut. Faisal kemudian melanjutkan kariernya di luar lingkungan kampus dengan mendirikan INDEF. Perjalanan mereka juga mencatat kembali kerja sama di era kepemimpinan Presiden Abdurrahman Wahid atau Gus Dur.
Sri Mulyani mengenang Faisal Basri sebagai individu yang penuh semangat kerja karena cintanya yang mendalam terhadap Indonesia."Bang Faisal memiliki tekad untuk mendorong kemajuan dan kebebasan dari korupsi di Indonesia, serta selalu bertarung untuk keadilan," ucapnya.
Melalui media sosialnya, Sri Mulyani mencatat bahwa Indonesia telah kehilangan suara jujur dan tokoh penting. Ia juga menaruh rasa hormat terhadap pandangan dan kritik yang diutarakan oleh Faisal Basri, karena meyakini bahwa Faisal memiliki niat tulus untuk memperbaiki negara.
Faisal Basri seringkali menjadi sosok yang mengkritik kebijakan pemerintah, terutama yang berkaitan dengan perekonomian. Salah satu kritiknya adalah mengenai utang negara yang terus meningkat. Ia pernah memperingatkan bahwa utang pemerintah yang semakin membesar akan membebani APBN. Kritik tajam juga dialamatkannya terhadap berbagai program pemerintah, seperti pembangunan Kawasan Ekonomi Khusus (KEK) hingga pengelolaan tambang nikel. Kritik-kritik tersebut tentu menjadi sorotan penting bagi pemerintah dalam rangka meningkatkan kualitas kebijakan yang dirancang.
