Ali juga mengungkapkan keberatannya atas perlakuan terhadap masyarakat kulit hitam di Amerika, mempertanyakan perlunya dirinya terlibat dalam perang Vietnam, sementara di Amerika sendiri, orang-orang kulit hitam diperlakukan tidak adil.
Ali menolak maju saat namanya dipanggil dalam acara pemanggilan resmi ke militer di Houston, dan akhirnya ditahan karena bersikeras untuk tidak merespons pemanggilannya. Setelah kejadian tersebut, lisensi bertinju Ali dicabut oleh Komisi Atletik Negara Bagian New York dan WBA. Hal ini menyebabkan Ali tidak dapat bertanding selama 3 tahun. Absennya dari panggung tinju cukup berpengaruh bagi kariernya, setelah kembali bertarung, ia mendapat kekalahan pertamanya dari Joe Frazier pada tahun 1970.
Tindakan Ali untuk menolak berperang demi Allah dan menunjukkan keberatannya terhadap perlakuan terhadap masyarakat kulit hitam di Amerika menjadi bukti kesetiaannya pada keyakinan dan nilai-nilai yang ia anut. Keputusannya tersebut juga mengundang perhatian publik terhadap isu-isu sosial dan politik yang terjadi pada masa itu.
