Perbedaan utama antara madu biasa dan madu hutan terletak pada sumber nektar dan lingkungan di mana lebah madu mengumpulkannya. Madu biasa memiliki sumber nektar yang terbatas pada tanaman bunga di sekitar sarang lebah, sementara madu hutan berasal dari nektar tanaman hutan yang lebih beragam. Karena lingkungan tanaman yang berbeda, madu hutan juga dapat memiliki kandungan nutrisi dan antioksidan yang lebih beragam dan kaya dibandingkan dengan madu biasa.
Selain perbedaan dalam sumber nektar, madu biasa dan madu hutan juga memiliki perbedaan dalam karakteristik rasa dan aroma. Madu biasa cenderung memiliki rasa dan aroma yang khas tergantung pada jenis tanaman bunga tempat nektar dikumpulkan. Sementara itu, madu hutan memiliki karakteristik rasa yang lebih kompleks karena berasal dari berbagai tanaman hutan yang berbeda.