Sebagai Ketua MPR RI, Bamsoet juga menekankan pentingnya peran legislatif dalam menyelesaikan isu-isu konflik di Papua melalui mekanisme dialog, legislasi, dan supervisi yang bertujuan untuk memastikan perlindungan terhadap hak asasi serta kepentingan masyarakat Papua.
Dukungan terhadap langkah-langkah TNI dalam menangani kelompok bersenjata di Papua, termasuk dalam hal penyebutan OPM, merupakan satu langkah vital dalam menjaga keamanan, kedaulatan, dan kesatuan Negara Kesatuan Republik Indonesia (NKRI). Selain itu, hal ini juga menunjukkan komitmen serius dari pemerintah dan pemangku kebijakan untuk melindungi seluruh warga Indonesia dan memastikan kesejahteraan serta keadilan di seluruh wilayah Indonesia, termasuk di Papua.
