Perlawanan ini mencapai puncaknya di tengah-tengah ketegangan antara penduduk setempat dan garnisun Portugis. Benteng Pendem menjadi saksi bisu dari pertempuran sengit antara para pejuang bangsa Indonesia dan tentara penjajah. Meskipun dalam kondisi kalah dalam segi persenjataan, semangat juang kaum pribumi tidak pernah pudar. Mereka terus bertahan dan menunjukkan kegigihan tanpa kenal lelah.
Namun, perjuangan mereka tidak sia-sia. Setelah bertahun-tahun berjuang, akhirnya Benteng Pendem berhasil dibebaskan dari cengkeraman penjajah Portugis. Hal ini merupakan sebuah kisah heroik yang diabadikan dalam sejarah perlawanan bangsa Indonesia terhadap penjajahan asing. Perlawanan di Benteng Pendem menjadi inspirasi bagi generasi-generasi selanjutnya untuk menjaga dan mempertahankan kemerdekaan serta martabat bangsa.
Mengutip seorang sejarawan, "Kisah pemberontakan di Benteng Pendem adalah bukti nyata bahwa semangat juang dan persatuan masyarakat lokal mampu mengalahkan kekuatan militer penjajah." Pemberontakan ini menjadi bagian dari jejak sejarah perlawanan bangsa Indonesia yang patut dihargai dan dikenang.
Benteng Pendem sekarang menjadi situs bersejarah yang dijaga dengan baik sebagai peninggalan berharga dari perjuangan para pejuang. Keberadaan Benteng Pendem dan kisah pemberontakan di dalamnya menjadi pengingat akan perjalanan panjang bangsa Indonesia menuju kemerdekaan dan keadilan.
