Namun industri akuakultur telah lama menjadi kontroversi - dengan adanya kekhawatiran yang signifikan terhadap penyakit pada ikan , pelepasan ikan ke alam liar, dan dampak lingkungan secara keseluruhan dari pemeliharaan ikan dalam keramba.
Peristiwa kematian besar, yang melibatkan kematian mendadak jutaan ikan telah didokumentasikan dengan baik, terkadang disebabkan oleh wabah penyakit namun juga terkait dengan suhu laut yang lebih hangat akibat perubahan iklim.
Di Skotlandia tahun lalu, data pemerintah menunjukkan bahwa lebih dari 17 juta salmon mati, jumlah terbanyak yang pernah tercatat. Para produsen menyalahkan lautan yang lebih panas sebagai penyebab kerugian tersebut.
Negara-negara lain bahkan mengalami angka kematian yang lebih besar. Norwegia mengatakan hampir 17% ikan budidaya mereka mati mendadak pada tahun 2023.