Namun, tidak semua debu kosmik memiliki efek positif. Debu-debu kosmik dengan ukuran yang besar dan kecepatan tinggi dapat menjadi ancaman bagi wahana antariksa maupun satelit yang beroperasi di luar angkasa. Benturan dengan debu kosmik ini dapat menyebabkan kerusakan serius pada peralatan luar angkasa, bahkan dapat menghancurkan satelit tersebut.
Dalam penelitian ilmiah, debu kosmik juga menjadi subjek kajian yang menarik. Misalnya, dengan menganalisis debu kosmik yang terdapat di luar angkasa, para ilmuwan dapat mempelajari asal usul tata surya dan bahkan asal usul alam semesta secara umum.