Adapun deretan PTS di Yogyakarta yang meraih akreditasi Unggul dari BAN-PT sebagai berikut:
1. Universitas Ahmad Dahlan (UAD)
UAD meraih peringkat akreditasi Unggul berdasarkan Surat Keputusan (SK) Direktur Dewan Eksekutif BAN-PT Nomor 393/SK/BAN-PT/Ak.KP/PT/V/2023. Status akreditasi itu berlaku selama lima tahun sejak 30 Mei 2023 hingga 11 Oktober 2027.
2. Universitas Aisyiyah (Unisa) Yogyakarta
Unisa Yogyakarta meraih akreditasi Unggul melalui SK Direktur Dewan Eksekutif BAN-PT Nomor 8/SK/BAN-PT/Ak/PT/I/2024. Akreditas itu didapatkan setelah Unisa Yogyakarta mendapatkan nilai total 369.
3. Universitas Atma Jaya Yogyakarta (UAJY)
UAJY mendapatkan peringkat akreditasi Unggul sebagaimana tertuang dalam SK Direktur Dewan Eksekutif BAN-PT Nomor 335/SK/BAN-PT/Ak.KP/PT/V/2023. Akreditasi itu berlaku terhitung mulai 10 Mei 2023 hingga 28 Maret 2028.
4. Universitas Islam Indonesia (UII)
UII memperoleh peringkat akreditasi Unggul berdasarkan SK Direktur Dewan Eksekutif BAN-PT Nomor 2003/SK/BAN-PT/Ak.Ppj/PT/XII/2022. Perolehan status akreditas itu terhitung sejak 28 Desember 2022 hingga 28 Desember 2027.