Selain itu, dedikasinya terhadap dunia sastra juga diakui melalui berbagai penghargaan yang pernah diraihnya, seperti Penghargaan Buku Puisi Dewan Kesenian Jakarta pada tahun 2001, Hadiah Sastra Lontar pada tahun 2001, South East Asian (SEA) Write Award pada tahun 2014, dan Anugerah Kebudayaan Gubernur Daerah Istimewa Yogyakarta pada tahun 2019. Semua penghargaan itu merupakan bukti atas kontribusi dan karyanya yang luar biasa dalam dunia sastra Indonesia.
Sebelum meninggal, Joko Pinurbo sempat dirawat di Rumah Sakit Panti Rapih, Yogyakarta, pada 13 November 2023. Kepergiannya meninggalkan kesedihan mendalam di hati para sahabat dan penggemar karyanya.
Selamat jalan, Pak JokPin. Semoga anda beristirahat dengan tenang dan bertemu dengan Yesus di surga sana. Doa dan dukungan selalu menyertai anda.