Meski begitu, tantangan terbesar bagi SteamOS adalah dukungan aplikasi pihak ketiga. Windows masih lebih unggul dalam menjalankan berbagai aplikasi gaming seperti Epic Games Store, Battle.net, dan Xbox Game Pass.
Dengan dibukanya akses SteamOS untuk perangkat non-Steam Deck, pasar OS gaming handheld semakin kompetitif. Jika Valve berhasil meningkatkan kompatibilitas aplikasi dan menghadirkan lebih banyak fitur, SteamOS bisa menjadi alternatif menarik bagi gamer yang ingin lepas dari ekosistem Windows.