Ada pula teori yang mengaitkan kejatuhan Majapahit dengan letusan gunung berapi dan bencana alam lainnya yang mengakibatkan kerusakan parah terhadap infrastruktur dan sumber daya alam. Di tengah keraguan mengenai faktor penyebab kehancuran Majapahit, keberadaan bekas-bekas situs Majapahit yang masih dapat ditemukan hingga saat ini menjadi saksi bisu kejayaan dan kehancuran peradaban yang misterius tersebut.