Memasuki museum, pengunjung akan melihat koleksi peninggalan perhiasan dan mahkota kerajaan. Semakin ke dalam ruangan berikutnya menampakkan berbagai koleksi pakaian adat kerajaan/kesultanan. Peninggalan tempat tidur, diorama tempat penyimpanan bayi yang baru lahir, hingga koleksi foto-foto sultan menjadi bahan penelusuran sejarah. Dalam museum Mulawarman juga ditampilkan keanekaragaman flora dan fauna serta kekayaan sumber daya alam pulau Kalimantan. Senjata api zaman Belanda, perlengkapan berburu dan perang tradisional, alat pembayaran pun menjadi koleksi khas yang menceritakan Kalimantan. Biaya masuk yang cukup murah, yaitu Rp 3.500 per orang untuk dewasa memang sebanding dengan masih minimnya informasi kerajaan dan keterangan pada koleksi museum.
