Selain itu, mikroba juga berperan dalam bidang kesehatan. Bakteri baik dalam sistem pencernaan manusia membantu dalam proses pencernaan makanan dan mempertahankan keseimbangan mikroba di dalam usus. Namun, di sisi lain, beberapa mikroba juga dapat menyebabkan penyakit jika tidak dikendalikan dengan baik.
Selain bakteri, virus juga termasuk dalam kelompok mikroba. Virus merupakan parasit obligat, yang artinya memerlukan inang untuk dapat berkembang biak. Virus dapat menyebabkan berbagai penyakit seperti flu, HIV, Ebola, dan lain sebagainya. Karena sifatnya yang kecil dan mudah menyebar, virus sering kali memerlukan penanganan khusus dalam dunia medis.
Di sisi lain, protozoa merupakan mikroba lain yang berperan dalam ekosistem. Beberapa jenis protozoa menjadi pemangsa bagi bakteri dan alga, sehingga mengontrol populasi mikroba lainnya. Selain itu, protozoa juga berperan dalam siklus nutrien di air dan tanah.
Terakhir, fungi juga merupakan mikroba yang memiliki peran penting dalam ekosistem. Fungi membantu dalam proses dekomposisi bahan organik dan membentuk hubungan simbiotik dengan tanaman, membantu dalam penyerapan nutrien dari tanah. Selain itu, beberapa spesies fungi juga digunakan dalam pembuatan makanan seperti keju dan roti.
