Struktur organisasi IMF dipimpin oleh Dewan Gubernur yang terdiri dari menteri keuangan atau gubernur bank sentral tiap negara anggota. Operasional harian dijalankan oleh Dewan Eksekutif yang didukung oleh staf profesional di berbagai departemen.
Sumber dana IMF berasal dari kontribusi modal (kuota) yang dibayarkan tiap anggota sesuai dengan kapasitas ekonominya. Dana ini kemudian dapat dipinjamkan untuk membantu negara-negara yang mengalami krisis finansial.
Indonesia sendiri pernah memanfaatkan pinjaman IMF di masa krisis moneter 1997-1998 dan awal 2000-an. Namun, Menteri Keuangan Sri Mulyani Indrawati memastikan bahwa utang Indonesia ke IMF telah lunas sejak lebih dari 15 tahun lalu. Utang tersebut, yang sempat mencapai 9,1 miliar dolar AS pada 1998, diselesaikan bertahap dan rampung pada era Presiden Susilo Bambang Yudhoyono, tepatnya pada Oktober 2006.