Dalam penilaiannya, Setara Institute menggunakan empat variabel utama yang menjadi penentu status kota toleran. Variabel-variabel ini mencakup aspek-aspek krusial dalam pembangunan masyarakat yang inklusif.
Keempat variabel tersebut adalah: Regulasi Pemerintah Kota, Tindakan Pemerintah Kota, Pernyataan dan Sikap Pemerintah Kota, dan Persepsi Masyarakat Sipil. Setiap variabel diukur dengan indikator-indikator spesifik untuk mendapatkan gambaran komprehensif.
Melalui pengukuran variabel-variabel ini, Setara Institute menilai sejauh mana suatu kota mampu menciptakan ruang hidup yang aman, adil, dan inklusif bagi seluruh warganya, tanpa diskriminasi berdasarkan agama, keyakinan, atau identitas lainnya. Peningkatan Depok menjadi bukti bahwa perubahan positif menuju masyarakat yang lebih toleran adalah mungkin.