Pesantren Syaikhona Kholil juga telah mengalami perkembangan pesat dalam bidang pendidikan, mulai dari tingkat dasar hingga pendidikan tinggi. Dengan adanya program pendidikan formal dan non-formal, pesantren ini semakin menarik minat para calon santri dari berbagai daerah.
Perlu dicatat bahwa kejadian ini juga menjadi perhatian bagi Kyai Nasih dan pihak pengelola pesantren. Mereka berharap agar turis yang berkunjung ke daerah tersebut bisa didampingi oleh pemandu agar tidak salah arah atau masuk ke area yang seharusnya tidak dikunjungi oleh wisatawan. Dengan demikian, potensi pariwisata di sekitar pesantren bisa dimanfaatkan sebaik mungkin tanpa mengesampingkan kepentingan dan kenyamanan para santri yang sedang belajar dan beraktivitas di pesantren.