Dengan memahami jejak sejarah pemberontakan di Benteng Pendem, generasi sekarang dapat belajar dari perjuangan para pahlawan terdahulu. Semangat keberanian, keadilan, dan persatuan dalam melawan penindasan harus senantiasa dijunjung tinggi, sehingga nilai-nilai keberanian dan keadilan dapat tetap hidup dalam setiap individu.
Kisah pemberontakan di Benteng Pendem adalah bagian tak terpisahkan dari sejarah perlawanan rakyat Nusantara terhadap penjajah Portugis. Arti pentingnya masih terus menginspirasi dan memotivasi kita untuk terus mempertahankan keadilan dan kemerdekaan. Benteng Pendem adalah saksi bisu dari semangat perlawanan yang tidak pernah padam, yang harus diwariskan kepada generasi-generasi selanjutnya sebagai inspirasi dan pelajaran berharga.
Dengan begitu, jejak sejarah pemberontakan yang terjadi di Benteng Pendem akan selalu membara dalam ingatan kita, sebagai pengingat akan semangat perlawanan yang harus tetap hidup di setiap zaman.