Namun, konflik antara Iran dan India tidak hanya berpusat pada persoalan ekonomi. Khamenei sebelumnya telah mengkritik India terkait isu-isu yang melibatkan Muslim di negara itu serta konflik di wilayah Kashmir yang mayoritas penduduknya adalah Muslim. Kritik terhadap India atas perlakuan terhadap Muslim juga telah memperdalam perselisihan antara Iran dan India. Hal ini menunjukkan ketegangan yang tak terduga antara kedua negara tersebut dalam kaitannya dengan isu agama.
Pernyataan kontroversial Khamenei ini menunjukkan kepedulian dan keprihatinan terhadap muslim di seluruh dunia dan menegaskan pentingnya solidaritas sesama umat Islam. Seraya memberikan perhatian terhadap perlakuan minoritas di India, India pun terpaksa untuk membuka matanya terhadap kritikan dan tekanan internasional.
Reaksi New Delhi yang keras atas komentar Khamenei menunjukkan betapa sensitifnya hubungan antara Iran dan India. Sementara India harus mempertimbangkan cara menanggapi kritik tersebut agar tidak merusak hubungan ekonomi dan politik yang sudah dijalin antara keduanya, Iran pun harus memikirkan kembali dampak dari kritiknya terhadap India terkait perlakuan terhadap minoritas Muslim.
