Iguana laut memiliki peran penting dalam ekosistem Kepulauan Galapagos. Mereka menjadi salah satu hewan paling penting dalam rantai makanan, memakan alga dan rumput laut yang menjadi sumber makanan bagi hewan-hewan lain di pulau tersebut. Selain itu, iguana laut juga menjadi sumber makanan bagi burung predator seperti burung camar dan burung hantu, menjadikan mereka sebagai bagian integral dari sistem ekologi Galapagos.
Meskipun iguana laut Galapagos telah dinyatakan sebagai spesies yang dilindungi, populasi mereka masih menghadapi ancaman serius dari perubahan iklim, degradasi habitat, dan gangguan manusia. Perubahan iklim dapat menyebabkan penurunan populasi alga dan rumput laut, sumber makanan utama iguana laut. Selain itu, aktivitas manusia seperti perburuan ilegal dan gangguan terhadap habitatnya juga menjadi ancaman serius bagi kelangsungan hidup iguana laut.
Untuk melindungi populasi iguana laut Galapagos, berbagai upaya konservasi telah dilakukan oleh pemerintah Ekuador dan lembaga konservasi alam. Penegakan hukum terhadap perburuan ilegal dan pengawetan habitat pantai menjadi fokus utama dalam upaya perlindungan spesies ini. Selain itu, pendidikan dan kesadaran masyarakat lokal dan wisatawan juga memainkan peran penting dalam upaya konservasi iguana laut.
