Fungsi lain dari plankton di laut adalah sebagai penanda lingkungan. Sebagian besar jenis plankton sangat sensitif terhadap perubahan lingkungan, termasuk suhu air, kadar garam, dan kualitas air. Oleh karena itu, keberadaan dan komposisi plankton dapat memberikan informasi berharga mengenai kesehatan ekosistem laut dan dampak perubahan lingkungan terhadap kehidupan laut.
Begitu banyak fungsi penting di dalam ekosistem laut, pengelolaan dan perlindungan plankton di laut menjadi sangat penting. Kegiatan manusia seperti polusi, perubahan iklim, dan penangkapan ikan berlebihan dapat mengancam keseimbangan populasi plankton, berdampak pada ekosistem laut dan sumber daya kelautan lainnya. Melindungi area-area penting bagi keberadaan plankton, serta mengurangi dampak negatif aktivitas manusia terhadap laut, menjadi langkah krusial dalam menjaga fungsi-fungsi vital plankton di laut.
