Memasuki babak kedua, PSBS Biak Numfor kembali unggul melalui gol dari Julian Velazquez pada menit ke-72. Usaha Persija Jakarta untuk menyamakan kedudukan terlihat, namun kegigihan tim tuan rumah membuat mereka harus kembali berhenti dengan gol bunuh diri dari Syahrian Abimanyu di menit 90.
Permainan agresif dari PSBS Biak Numfor terbukti lebih efektif dalam memanfaatkan peluang yang ada. Meskipun Persija Jakarta juga berusaha keras untuk memberikan tekanan balik, namun tidak mampu menahan serangan bertubi-tubi dari tim tuan rumah.
